Codes for "A trait-discretized tau-leaping method for eco-evolutionary individual-based models with continuous trait values"

Abstract

本MATLAB代码包以Dieckmann-Doebeli模型为例,提供了Direct方法和基于性状离散化的tau-leaping方法的可复现实现。它包含了本研究中使用的短期和长期模拟程序、用于生成初始种群的启动程序,以及用于计算Wasserstein-1距离(W1)和最大直方图误差(MHE)的函数。每个模拟文件夹都可以独立运行,模型参数、算法设置、随机种子、记录规则、依赖关系和调试指南均有清晰的文档说明。随附的指南还解释了如何将该框架应用于其他基于事件的个体模型。